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[行业动态] 科“炎”直通车丨NLRP3炎性小体激活调控与靶向药物研究综述——陶术化合物库

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药徒
发表于 2022-11-1 15:23:48 | 显示全部楼层 |阅读模式

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炎症反应,是机体应对入侵异物常见的生理、病理活动。其中炎性小体发挥了重要的作用。NOD 样受体热蛋白结构域蛋白 3 (NLRP3) 是其中一种起到关键作用的蛋白。然而其异常的激活也会导致自身炎症性疾病的发生。因此,针对 NLRP3 在炎症反应中被激活和调控的机制研究,对于相关靶向药物的研发具有重要的意义。来,搭上T仔号文献列车,出发~
一、NLRP3概述
NOD 样受体热蛋白结构域蛋白 3 (NLRP3) ,是一种应对细胞压力信号的胞质免疫因子。作为NOD样受体家族的一员,通常情况下会在生命体受到感染或炎症时被激活,形成 NLRP3 炎性体 ,诱导细胞凋亡。

然而,少数情况下, NLRP3 会由于种种原因被异常激活,导致严重的自身炎症,如 II 型糖尿病、阿尔茨海默病 (AD) 、动脉粥样硬化和痛风等。与此同时, NLRP3 的突变也会导致自身炎症性低温综合征 (CAPS) 。

因此, NLRP3 在炎症相关疾病的治疗中成为一个被高度关注的因子,多种靶向 NLRP3 的药物也已进入临床实验阶段。


▲Nod样受体基因家族域结构[1]
今天就让 T 仔来为大家带来来自 Nature 子刊 Cellular & Molecular Immunology 的一篇综述“How location and cellular signaling combine to activate the NLRP3 inflammasome”,一起来了解下 NLRP3 的激活与调控机制吧~
二、NLRP3的激活
NLRP3 ,包含一个 pyrin 结构域 (PYD) ,一个与 ATP 酶活性结合所需的 NACHT 结构域和一个富亮氨酸重复序列 (LRR) 基序。在检测到激活刺激后,会由无活性的同源多聚体转变为活性多聚体炎性体,促进接头分子 ASC 的组装,激活半胱天冬酶-1 (caspase-1) ,诱导 IL-1 家族和 gasdermin D 中促炎细胞因子的蛋白水解切割和激活,最终导致溶解细胞死亡。

通常而言,触发 NLRP3 激活的因子包括细菌毒素尼日利亚菌素、细胞外 ATP 、胆固醇、多种微粒:尿酸钠 (MSU)晶体、明矾、硅颗粒(二氧化硅)以及淀粉样蛋白、糖酵解或线粒体的变化电子传输链 (ETC) 等,但由于 NLRP3 复杂而多样化的触发机制, NLRP3 也会在无菌状态下被异常激活而触发自身炎症和炎症性疾病。下文,将介绍一些已知的 NLRP3 激活机制。


▲NLRP3 炎症小体激活示意图[2]
  • 钾(Potassium)
胞外钾浓度增加被认为是 NLRP3 被激活形成炎性体的一般上游要求。在许多 NLRP3 激活剂中都观察到了钾流出的现象,如钾离子载体尼日利亚菌素、短杆菌肽和成孔毒素能使质膜透化导致钾离子的流出、细胞外 ATP 通过介导 P2X7 通道和 TWIK2 双孔结构域开放触发钾离子外流,以及一些颗粒,如胆固醇晶体、二氧化硅、焦磷酸钙晶体等都能诱导钾的流出。

但也有一些不依赖钾外流就能激活NLRP3的途径,如咪喹莫特及其相关化合物 CL097 ,或是一些通过 TLR4-TRIF-RIPK1-FADD-CASP8 依赖性级联激活 NLRP3 的途径。因此仍需进一步的研究来阐明钾外流是否是 NLRP3 激活的必须条件,以及其具体的分子机制。

  • 氯化物(Chloride)
与钾类似,氯化物外流在 NLRP3 炎性体的组装中也发挥了重要的作用。研究表明,能够控制氯的流出的氯离子胞内通道蛋白 1 (CLIC1) 和 4 (CLIC4) 参与了 NLRP3 的激活。但单独的氯化物流出仅能介导 ASC 结合和寡聚化,并不足以形成功能性的炎性体,后续的 caspase-1 裂解和 IL-1β 释放步骤还需钾流出的协助。


▲NLRP3 细胞定位[3]
  • 线粒体(Mitochondria)
线粒体 DNA (mtDNA) 是一种有效的免疫刺激因子, mtDNA 在细胞质中的释放会触发多种炎症反应,并响应多种细胞应激触发因素,其中也包括 NLPR3 激活剂,如 ATP 、己糖激酶 (HK) 、尼日利亚菌素等。且多项研究均表明,被氧化的 mtDNA (ox-DNA) 与 NLRP3 的激活有关。

线粒体 ROS (mtROS) ,有线粒体复合物 III 和复合物 I 产生,其水平随细胞应激以及电子传递链扰动而增加,在以往也被认为与 NLRP3 的激活有关。但缺乏复合物 III 的模型实验表明NLRP3的激活可能并不依赖于 mtROS ,与 NLRP3 激活一同上升的 mtROS 水平可能是由 NLRP3 的激活剂触发的。

线粒体自噬,是线粒体用于防止自身功能失调和受损的手段。自噬缺陷线粒体的相关实验表明,自噬的抑制会通过一系列 NLRP3 激活剂(包括 ATP 、尼日利亚菌素和溶酶体破坏)来促进 NLRP3 的激活。

  • 溶酶体损伤(Lysosomal damage)
溶酶体损伤或破坏是许多病理条件下 NLRP3 炎性体激活的关键机制。通常由内源性颗粒的吞噬作用触发,包括单钠尿酸盐 (monosodium urate, MSU) 晶体、基于胆固醇或脱氧鞘脂的脂质晶体和淀粉样蛋白- β 聚集体,或是外源性微粒,包括二氧化硅、石棉和明矾等。被吞噬的晶体在溶酶体室中积聚,导致溶酶体酸化增加、溶酶体肿胀、溶酶体膜完整性丧失,最终导致 NLRP3 炎性体激活。

  • 内质网(Endoplasmic reticulum)
内质网是调节胆固醇稳态的主要细胞器,化合物诱导的 ER 应激会引起钾外流和 ROS 的产生从而触发 NLRP3 依赖性 IL-1β 释放。同时,也有研究表明胆固醇稳态的改变与炎症反应的失调有关,胆固醇的积累对 NLRP3 具有激活作用,而胆固醇的合成抑制会降低 NLRP3 活性。

  • 高尔基体(The Golgi apparatus)
高尔基体作为近期 NLRP3 激活机制研究的焦点, NLRP3 刺激物会触发高尔基体周围线粒体及相关内质网膜 (MAM) 的聚集,促进蛋白激酶 D (PKD) 在 NLRP3 的 C293 位点处磷酸化,导致 NLRP3 从 MAM 中释放并被激活形成炎性体。与此同时,糖原合酶激酶 3β (GSK3β) 通过驱动磷脂酰肌醇-4-激酶 2 α (PI4k2A) 的磷酸化控制 NLRP3 向线粒体和高尔基体的募集,也是一种重要的 NLRP3 激活调节因子。

三、NLRP3炎性体激活的翻译后修饰调控
◆ 泛素化/去泛素化
泛素化,是通过 E3 泛素连接酶催化异肽键与赖氨酸残基的连接的生物学过程。
在NLRP3中,常见的泛素化位点有 K48 或 K63 连接位点,可以靶向 NLRP3 进行蛋白酶体降解或阻止蛋白质-蛋白质相互作用来负调节炎性小体激活的不同步骤。一般来说, E3 泛素连接酶有助于维持低水平的 NLRP3 ,如 F-box/LRR 重复蛋白 2 、 TRIM31 蛋白通过在 k689 、 k48 位点的泛素化诱导 NLRP3 降解。而去泛素化是 NLRP3 激活的必要步骤,一些泛素特异性肽酶 (USP) 的敲低,如 USP7 和 USP47 ,会减少 ASC 模块的形成和炎症小体的激活。

◆ 磷酸化/去磷酸化
NLRP3 通过丝氨酸或酪氨酸残基上添加一个磷酸基团来完成磷酸化。
磷酸化在调节 NLRP3 寡聚化和定位中起到了主要的作用,并协调 NLRP3 激活所需的信号网络。NLRP3发的磷酸化可以通过阻止 NLRP3 的意外寡聚化或是诱导自噬依赖性 NLRP3 降解来抑制 NLRP3 的激活。相反的,一些介导去磷酸化的因子,如肿瘤抑制因子磷酸酶和张力蛋白同源物 (PTEN) ,则会诱导 NLRP3 与 ASC 的相互作用,形成炎性体。


▲NLRP3 的翻译后修饰 (PTM) [3]
四、NLRP3靶向治疗进展
NLRP3 的异常激活所驱动的炎症是许多慢性退行性疾病的基础,包括 II 型糖尿病、痛风、动脉粥样硬化、炎症性肠病和阿兹海默病。因此,NLRP3 的抑制成为许多这些疾病的潜在治疗策略。

近年来,NLRP3 抑制剂的开发一直在大力推进。迄今为止已开发并进入临床试验的化合物包括 IFM-2427 (IFM/Novartis) 、Somalix (Inflazome) 、dapansutrile (Olatec) 和 NT-0167 (Nodthera) 。其中,通过与 NLRP3 的 NACHT 结构域结合直接抑制 NLRP3 炎性体的化合物和策略具有更高的特异性。

在结构靶向性方面,近期两个非活性 NLRP3 的冷冻电镜结构的研究表明,NLRP3 通常以非活性形式存在,呈多聚体的笼状构象,这种构象需要 LRR 中的酸性环与相邻 LRR 中的碱性结构域配对。而靶向该结构域的抑制剂 CP-456 , 773 可以通过在 ATP 结合 Walker A 基序位点附近与 NLRP3 结合,以稳定 NACHT 结构域的非活性构象,实现对NLRP3的抑制。这提示我们,靶向该位点的化合物可以通过稳定NLRP3 的非活性多聚物的形式,以防止其激活,为 NLRP3 抑制剂的设计或改变提供又一重要信息。

此外还有几种 NLRP3 炎性体抑制剂, T 仔以表格的形式列在了下方,一起来看看吧~


▲Nlrp3 炎性体抑制剂的药理应用[2]

以上就是 NLRP3 的激活调控以及相关靶向药物的近期研究,让我们一起期待后续更深入的机制研究,助力靶向药物的开发吧~
参考文献:
[1]Wang L, Hauenstein AV. The NLRP3 inflammasome: Mechanism of action, role in disease and therapies. Mol Aspects Med. 2020;76:100889. doi:10.1016/j.mam.2020.100889
[2]Shao BZ, Xu ZQ, Han BZ, Su DF, Liu C. NLRP3 inflammasome and its inhibitors: a review. Front Pharmacol. 2015;6:262. Published 2015 Nov 5. doi:10.3389/fphar.2015.00262
[3] Akbal A, Dernst A, Lovotti M, Mangan MSJ, McManus RM, Latz E. How location and cellular signaling combine to activate the NLRP3 inflammasome [published online ahead of print, 2022 Sep 20]. Cell Mol Immunol. 2022;10.1038/s41423-022-00922-w. doi:10.1038/s41423-022-00922-w

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