10年过去了。1939年的欧洲战火纷飞。希特勒德国的飞机不断轰炸英伦三岛,大批伤员因感染死亡。牛津大学的生物化学家钱恩(Ernst Boris Chain 1906-1979)和弗洛里(Howard Walter Florey)重新发现了弗箂明10年前的工作,便着手从青霉菌的培养滤液中纯化青霉素的工作。他们将酸化的醚或醋酸戉酯加入到滤液中,并不断拌搅,去除杂质后,在低温下使溶液蒸发,最终获得了一种性质稳定的、具有强杀菌作用的化合物,经过一年多的努力后,他们终于获得了少量的青霉素纯品。初步临床应用效果奇佳。即使稀释几十万倍仍具有令人惊奇的疗效。但在当时的英国不具备大批量生产的能力。1941年6月弗洛里来到美国寻求产业界支持,但美国政府立即从中看出了巨大的经济和社会效益,立即将青霉素的开发作为国家项目实施。1941年12月美国参战后,开发进程加快。生产工艺很快成熟,大批青霉素被生产出来。青霉的应用拯救了成千上万人的生命,有人将它与雷达和原子弹一起称为二战期间的三项伟大发明。