基于英国和冰岛人群研究的大规模蛋白质组学

蒲公英媒体助手

基于英国和冰岛人群研究的大规模蛋白质组学

在今天发布的一篇论文中，deCODE Genetics的科学家分享了他们使用基于亲和力方法进行的血浆蛋白质组学研究结果。 他们分析了在基因组序列中的疾病和多样性背景下的蛋白质，并比较了使用两个平台测量的数千种蛋白质的结果，这些样本分别来自英国生物银行和冰岛的大型群体。


今天，制药公司安进（Amgen）的子公司deCODE Genetics的科学家们在《自然》展示了血浆蛋白质组学可以如何帮助了解疾病。 该研究团队专注于血浆蛋白质组，并从中发现了各种疾病与特定蛋白质水平之间的关联。 deCODE genetics的科学家兼该论文的高级作者之一 Patrick Sulem 表示："在基于人群的分组中测量大量蛋白质可以发现循环中的生物标志物并及早检测疾病。"


Kari Stefansson, Grimur Hjorleifsson and Patrick Sulem, scientists at deCODE genetics and authors on the paper.
Kari Stefansson, Grimur Hjorleifsson and Patrick Sulem, scientists at deCODE genetics and authors on the paper.
此外，科学家们还利用影响蛋白质水平的遗传因素来阐明序列变异关联与疾病的发生原因之间的生物联系。 "序列变异与疾病之间的生物关系往往难以捉摸。 将蛋白质基因组学纳入分析可以发现疾病发展的分子机制。"deCODE genetics科学家 Kári Stefánsson 表示。


科学家们利用奥凌探索（Olink Explore）平台上的2,941个免疫分析分析了来自英国生物银行的大约50,000份欧洲、非洲和亚洲血统个人的数据。 这些数据由英国生物银行制药蛋白质组学项目 (UKB-PPP)生成，这是由包括安进在内的13家生物制药公司组成的联盟，旨在研究循环蛋白的生物标志物。 作者将这些研究结果与先前的一项研究进行了比较，他们在SomaScan平台上使用了4,907个基于适配体的分析方法分析了大约40,000名冰岛人的数据。 他们总共发现了序列变异和蛋白质水平之间的80,000多种关联，以及超过500,000种疾病和其他蛋白质水平特征的关联。


科学家们在使用两个平台检查样本的其中一组子集时，观察到其在蛋白质水平测量结果上的差异 。 这些平台之间的差异影响了循环疾病生物标志物的发现，同时影响蛋白质水平和疾病表现的遗传因素的检测。 通过对冰岛和英国的大型群体进行研究，大量的关联可以被检测出来，也让比较结果变得显著。 作者团队强调了逐个案例单独分析的价值。


deCODE genetics首席执行官兼该论文的高级作者之一Kári Stefánsson表示："虽然这两个蛋白质组学平台是在大型数据集中同时测试数千种蛋白质的实用工具，但我们仍需要对个体蛋白质进行仔细验证。"


deCODE总部位于冰岛雷克雅未克，是分析和理解人类基因组的全球领导者。 利用其独特的专业知识和人口资源，deCODE已发现了数十种常见疾病的遗传风险因素。 了解疾病基因学是为了利用这些信息建立诊断、治疗和预防疾病的新方式。deCODE是安进（纳斯达克: AMGN）的全资子公司。

消息来源 : deCODE genetics