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[统计应用] 新型冠状病毒感染的肺炎统计分析

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药生
发表于 2020-2-2 14:19:58 | 显示全部楼层 |阅读模式

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新英格兰医学期刊 New Englalnd Journal of Medicine :《新型冠状病毒感染的肺炎在中国武汉的早期传播动力学》

2020年1月29日



R₀: 基本传染数
确诊时间截至1月22日, 研究组分析了武汉市425例确诊病例的资料。使用MATLAB软件(MathWorks)对潜伏期,序列间隔,生长速率和R₀进行分析。 使用SAS软件(SAS Institute)和R软件(R Foundation for Statistics Computing)进行了其他分析。


根据这些信息,有证据表明自2019年12月中以来在亲密接触者之间已经发生了人与人之间的传播。平均潜伏期为5.2天 (95%置信区间[CI]为4.1-7.0),分布的第95个百分位数 (95th percentile)为12.5天。 在早期阶段,该流行病每7.4天扩大一倍。 平均序列区间为7.5天 (95%CI,5.3-19),R₀估计为2.2 (95%CI,1.4-3.9)。估计R₀约为2.2,这意味着平均每个患者将感染传播给2.2个其他人。


WHO在 1 月 23 日估算R₀ 在 1.5-2.5 之间。香港研究员估算R₀ 在2.56 (95% CI, 2.49−2.63)

但是,较高的R₀并不意味着病毒比具有较低R₀的病毒更致命。 感染率和期限是两个独立的问题。

只要R₀大于1,疫情就会增加。控制措施旨在R₀将减少到1以下, 意味着传染病将会逐渐消失。这是一个很大的警告:R₀不是固定的, 动态变化的 R₀ 值是关注的一个指标。





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药生
 楼主| 发表于 2020-2-3 10:53:30 | 显示全部楼层
预测源自中国武汉的2019-nCoV爆发的潜在国内和国际传播


鉴于武汉市已不能包容2019-nCoV,其他中国主要城市可能正在维持局部爆发。 除非与人口和个人层面都实施实质性公共卫生干预措施,否则与中国有着紧密交通联系的海外大城市也可能成为暴发中心。 由于大量的症状前病例出口和缺乏大规模公共卫生干预措施,全球主要城市的自我维持爆发可能变得不可避免。 应对准备计划和缓解措施做好准备,以便在全球范围内快速部署。






图2总结了我们对截至2020年1月25日武汉市基本R₀和2019-nCoV爆发规模的估计。在我们的基准情景中,我们估计R₀为2.68(95%CrI 2.47-2.86)的流行倍增时间为6.4天(95%的CrI 5.8-7.1)。

我们估计,截至2020年1月25日,武汉地区已感染75,815个人 (95%CrI 37,304–130,330)。

图2武汉地区估计基本R₀和估计爆发规模的后验分布



估计截至2020年1月25日。病例与有症状或传染性感染相对应。 病例数小于感染数,因为一些感染者仍处于潜伏期。 我们假设受感染的个体在潜伏期没有感染力(即类似于严重的急性呼吸综合征相关冠状病毒)。 PDF =概率密度函数。 FOI =感染力。


图3估计武汉出境旅行量最大的中国城市的病例数





图4在传播力和城市间流动性减少的不同情景下,武汉和其他五个中国城市的疫情预测
LANCET.jpg
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发表于 2020-2-5 09:59:57 | 显示全部楼层
很形象,很全面
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药生
 楼主| 发表于 2020-2-18 13:28:30 | 显示全部楼层
本帖最后由 kslam 于 2020-2-18 13:38 编辑

COVID-19的传染数(R₀)相比更高于SARS冠状病毒

2020年2月13日发布

我们的审查发现,2019-nCoV的平均R₀为3.28,超过了WHO估计的1.4至2.5。
Journal of Travel Medicine.jpg
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药生
 楼主| 发表于 2020-2-18 17:35:24 | 显示全部楼层

下面是一些传染病的基本传染数




由于每个感染者平均会感染超过一个人,因此感染这种疾病的人数将呈指数增长。


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