新技术可鉴别肿瘤细胞“间谍”

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香港科技大学的研究人员开发了一种新技术，可以在冷冻和新鲜组织的单个细胞中同时进行基因组DNA和RNA测序。并用这种方法鉴定出了伪装成正常细胞的罕见脑肿瘤细胞“间谍”，这一突破可帮助促进部分罕见肿瘤的研究进展，可以为未来的药物靶点发现开辟新的方向。

基因组DNA和RNA测序可提供有关肿瘤基因组，分子组成和细胞异质性的重要信息，这些信息会影响疾病病理学以及肿瘤产生耐药性的能力，对于癌症的治疗至关重要。

我们目前对癌症的了解并不能完全解释肿瘤复发和对治疗产生耐药性的原因。但通过同时观察DNA和RNA来探索高分辨率肿瘤组成的新维度可能会提供答案。然而，现有技术在冷冻生物库组织的单细胞中同时进行DNA和RNA测序的适用性有限，但这些冷冻组织构成了大多数现成的临床癌症样本。

近日，由香港科技大学生命科学系及化学生物工程系副教授吴安琪教授及其博士后余磊博士领导的团队，研发出一种新的多功能单细胞多组学分析技术scONE-seq，可以分析冷冻细胞和难以获得的细胞类型。这种新方法还可以通过“一锅反应”同时收集肿瘤中的基因组和转录组信息。

原文链接：
Lei Yu, scONE-seq: A single-cell multi-omics method enablessimultaneous dissection of phenotype and genotype heterogeneity from frozentumors, Zenodo (2022). DOI: 10.5281/zenodo.6796059