咨询关于MLST分子分型技术

Damon_Shi

想请教下圈内有大神了解关于MLST的相关原理介绍么？
想了解如何解读下方微生物溯源关系，之前理解以为是通过DNA碱基序列，但后来发现理解并不正确，想看看有没有专业的介绍便于了解呢，谢谢！

机智鼠

MLST（多位点序列分型）是一种通过测定细菌多个管家基因内部序列变异来实现菌株分型的分子技术。其原理是选取6-10个管家基因，通过PCR扩增其400-600bp片段并进行测序，根据序列差异分配等位基因编号，组合形成序列型（ST）作为菌株分型依据。

关于微生物溯源关系的解读，MLST通过比较不同菌株之间的遗传距离和种系关系来揭示其进化关系。具体来说，MLST技术通过对选定的管家基因进行PCR扩增和测序，得出每个菌株各个位点的等位基因数值，然后上传到在线数据库中进行分析，以确定不同菌株之间的遗传相似性和差异。

例如，当分析一株大肠杆菌时，首先选择多个管家基因进行扩增和测序，得到一系列等位基因编号。这些编号组合成一个唯一的序列型（ST），用于代表该菌株。通过将该ST与数据库中的其他菌株进行比对，可以确定其亲缘关系和进化路径。

MLST在食源性疾病暴发溯源、病原菌进化关系分析等领域具有广泛应用。希望以上信息能帮助您更好地理解MLST及其在微生物溯源中的应用。

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